À Fujisawa, où le ciel est radieux et la mer scintillante, Sakuta Azusagawa est en deuxième année de lycée. Ses jours heureux aux côtés de sa petite amie, Mai Sakurajima, une élève d’une classe supérieure, sont bouleversés par l’apparition de son premier coup de cœur, Shouko Makinohara. Pour des raisons inconnues, il se retrouve face à deux Shouko : l’une au collège et l’autre devenue adulte. Alors que Sakuta se retrouve contraint de vivre avec les deux Shouko, la Shouko adulte le mène par le bout du nez, provoquant une profonde rupture dans sa relation avec Mai. Au milieu de tout cela, il découvre que la Shouko du collège souffre d’une grave maladie et sa cicatrice se met à palpiter…