Le 10 août 2010, le Saint Empire de Britannia lança une campagne de conquête visant le Japon. Les opérations furent menées à bien en un mois grâce au déploiement par la Britannia de nouveaux véhicules blindés humanoïdes mobiles, baptisés « Knightmare Frames ». Le Japon a été dépouillé de ses droits et de son identité ; cette nation autrefois fière est désormais appelée « Zone 11 ». Ses citoyens, les « Elevens », sont contraints de gagner péniblement leur vie tandis que l’aristocratie britannique vit confortablement au sein de ses colonies. Des poches de résistance apparaissent un peu partout dans la Zone 11, œuvrant pour l’indépendance du Japon. Lelouch, un prince impérial de Britannia en exil se faisant passer pour un étudiant, se retrouve au cœur du conflit qui fait rage pour cette nation insulaire. Grâce à une rencontre fortuite avec une mystérieuse jeune fille nommée C.C., Lelouch acquiert son Geass, le pouvoir du roi. Désormais doté d’une domination absolue sur n’importe qui, Lelouch pourrait enfin réaliser son objectif : renverser la Britannia de l’intérieur !