Les incidents survenus les 14 et 15 août ont réuni un groupe de jeunes garçons et filles… Ils font partie d’un groupe qu’ils appellent eux-mêmes le « Mekakushi Dan » (l’Organisation aux yeux bandés) et chaque membre possède un pouvoir étrange lié à ses yeux. Les membres de cette organisation singulière parviendront-ils à élucider les mystères qui se cachent derrière ces incidents et à découvrir la vérité ? Une histoire inspirée de la nouvelle série musicale à succès de Jin (Shizen no Teki-P) intitulée « Kagerou Project ».