Kousaka Kyousuke, un lycéen de 17 ans tout à fait ordinaire vivant à Chiba, ne s'entend plus avec sa petite sœur Kirino depuis des années. D'aussi loin qu'il se souvienne, Kirino a toujours ignoré ses allées et venues et l'a toujours regardé avec mépris. Il semblait que la relation entre Kyousuke et sa sœur, désormais âgée de quatorze ans, allait rester ainsi pour toujours. Un jour cependant, Kyousuke trouve un boîtier de DVD d'un anime mettant en scène une fille dotée de pouvoirs magiques, tombé dans l'entrée de sa maison.