Hodaka, lycéen, quitte son île isolée pour s'installer à Tokyo, mais se retrouve aussitôt sans le sou. Il mène une vie solitaire, mais finit par trouver un emploi de rédacteur pour un magazine occulte douteux. Dès qu'il commence à travailler, il ne cesse de pleuvoir jour après jour. Dans un coin de cette ville bondée et animée, Hodaka fait la connaissance d’une jeune femme prénommée Hina. Pour diverses raisons, Hina et son petit frère vivent ensemble, mais mènent une vie joyeuse et sereine. Hina possède également un certain pouvoir : celui d’arrêter la pluie et de faire dégager le ciel.