Après sa victoire contre le lycée Yousen, l'équipe de basket-ball de Seirin s'est qualifiée pour les demi-finales de la Coupe d'hiver aux côtés de Kaijou, Rakuzan et Shuutoku. Chacune de ces équipes compte dans ses rangs un membre de la « Génération des miracles », et Seirin se prépare à affronter les plus grands obstacles sur son chemin vers la victoire en Coupe d'hiver. Dans la dernière saison de Kuroko no Basket, Kuroko affronte une nouvelle fois ses anciens coéquipiers, bien décidé à leur prouver que le talent individuel n’est pas la seule façon de jouer au basket. Sa conviction inébranlable que sa façon de jouer, axée sur le jeu d’équipe, est la bonne manière de pratiquer ce sport va se heurter au talent d’une copie parfaite et à une autorité absolue. Alors que Kuroko tente de prouver que sa conception du basket-ball est la « bonne », lui et le reste du lycée Seirin n’ont en fin de compte qu’un seul objectif : remporter la Coupe d’hiver et venir à bout de la « Génération des Miracles », qui domine depuis longtemps la scène du basket-ball au collège et au lycée.