En Floride, en 2011, Jolyne Kuujou se retrouve enfermée dans une cellule de prison, tout comme son père Joutarou avant elle ; pourtant, elle n’a pas choisi cette situation. Accusée à tort d’un crime qu’elle n’a pas commis et manipulée pour purger une peine plus longue, Jolyne est prête à se résigner à un destin funeste en tant que prisonnière de la prison de Green Dolphin Street. Alors que tout espoir semble perdu, un cadeau de Joutarou finit par éveiller ses capacités latentes, qui se manifestent sous la forme de son Stand, Stone Free. Désormais dotée du pouvoir de changer son destin, Jolyne se met en quête d’un moyen de s’échapper de cet océan de pierre qui la retient prisonnière. Cependant, elle découvre bientôt que son incarcération n’est qu’une infime partie d’un vaste complot : un complot qui ne vise pas seulement sa famille, mais qui a également des conséquences bien plus vastes. De plus, le cerveau de l’opération se cache au sein même de cette prison et bénéficie de la protection d’une bande d’utilisateurs de Stand menaçants. Trouvant des alliés inattendus pour l’aider dans sa cause, Jolyne se lance dans une quête pour déjouer leur complot, laver son nom et reprendre le contrôle de sa vie.