Shinra et la Compagnie 8 ont compris l'objectif de l'Évangéliste : récupérer les « Adolla Bursts » de Shinra et Shou. Après avoir appris davantage sur son passé grâce au capitaine Burns, Shinra est plus que jamais déterminé à découvrir la vérité sur sa mère et à sauver Shou une nouvelle fois. Mais une mystérieuse jeune fille, connue sous le nom de « Premier Pilier », révèle le plan d’ensemble de l’Évangéliste : déclencher un nouveau Grand Cataclysme !