Après avoir célébré leur victoire contre Al-Thamen, Aladdin et ses amis quittent le royaume de Sindria. Mais la fin de la bataille marque aussi le moment où chacun doit prendre des chemins différents. Hakuryuu et Kougyoku reçoivent l'ordre de retourner dans leur pays d'origine, l'Empire de Kou. De son côté, Aladdin annonce qu'il doit se rendre à Magnostadt — un pays mystérieux gouverné par des magiciens — afin d'enquêter sur les événements étranges qui s'y déroulent et de perfectionner ses compétences en magie. De leur côté, encouragés par les paroles d’Aladdin, Alibaba et Morgiana se mettent également en route pour poursuivre leurs propres objectifs : s’entraîner et se rendre dans son pays natal, respectivement. Magi : Le Royaume de la Magie suit ces amis alors qu’ils mènent chacun leurs propres aventures, chacun faisant face à ses propres défis. Cependant, une nouvelle menace commence à se profiler alors qu’une grande guerre se profile à l’horizon… [Écrit par MAL Rewrite]