La Lune commence à tomber, et au rythme où vont les choses, elle est vouée à s'écraser sur la Terre. Le compte à rebours pour la survie de la planète commence. Au milieu de ce chaos, Hanabi, la petite sœur de Hinata, est capturée par un ennemi mystérieux, Toneri Ootsutsuki. Naruto doit affronter de grands dangers lors d’une mission visant à sauver Hanabi et le monde, aux côtés de Hinata, Sai, Shikamaru et Sakura : c’est leur histoire finale. « L’histoire finale, c’est un premier amour. »